Оценка риска смерти у пациентов, инфицированных британским вариантом SARS-CoV-2 VOC-202012/1

Дата: 30 марта 2021
Дополнительная информация

Вступление

В октябре 2020 года новая линия SARS-CoV-2 (B.1.1.7) была идентифицирована на юго-востоке Англии, а в середине декабря 2020 года Великобритания сообщила Всемирной организации здравоохранения о распространении нового вариант вируса VOC-202012/1 (так называемый британский вариант SARS-CoV-2). [Что известно о новых вариантах SARS-CoV-2?] В конце декабря 2020 года Франция и другие европейские страны решили приостановить международное воздушное, наземное и морское сообщение с Великобританией, чтобы ограничить распространение нового варианта вируса в другие страны. Несмотря на принятые меры предосторожности, новый вариант SARS-CoV-2 также был обнаружен в других странах. С тех пор его распространенность увеличилась как в Европе, так и в США. Секвенирование VOC-202012/1 позволило идентифицировать 14 генетических мутаций, восемь из которых произошли в гене, кодирующем S-белок. Наличие этих мутаций может привести к облегчению проникновения вируса в клетки, увеличению силы связывания S-белка с рецептором АПФ2 и избеганию иммунного ответа. Влияние мутаций на инфекционность, клиническую картину и уровень летальности пациентов до сих пор оставался малоизученным. Группа исследователей из Великобритании провела анализ, чтобы определить, связано ли заражение новым вариантом SARS-CoV-2 с более высоким риском смерти по сравнению с другими вариантами вируса.

Методы

За отчетный период количество случаев COVID-19 в Великобритании резко возросло, что, в свою очередь, привело к перегрузке систем здравоохранения и могло повлиять на уровень летальности. Во избежание влияния мешающих факторов, напр. связанных с перегрузкой системы здравоохранения, в этом исследовании использовалась соответствующая выборка для контрольной группы с учетом возраста, пола, происхождения, места жительства и продолжительности госпитализации. Критерии включения в исследование включали: возраст старше 30 лет и положительный результат теста на наличие COVID-19, обнаруженный в период с 1 октября 2020 года по 29 января 2021 года. Исследование проводилось в референс-лабораториях Lighthouse. Тесты ПЦР Thermo TaqPath в Великобритании показали тесную корреляцию между случаями VOC-202012/1, подтвержденными секвенированием, и результатами ПЦР TaqPath, в которых не были обнаружены фрагменты последовательности гена, кодирующего S-белок, но были обнаружены последовательности генов N и ORF1ab. Этот результат считается отрицательным для гена S и тесно связан с заражением новым вариантом SARS-CoV-2 в Великобритании. На основании полученных результатов ПЦР-теста пациенты были разделены на две группы: с положительным и отрицательным результатами наличия  фрагментов последовательности гена, кодирующего S-белок. Затем был проанализирован риск смерти в течение 28 дней после получения положительного результата теста на наличие SARS-CoV-2 в обеих исследуемых группах.

Полученные результаты

Было проанализировано 54 906 подобранных пар пациентов с положительным результатом теста на наличие SARS-CoV-2 в период с 1 октября 2020 года по 29 января 2021 года. Наблюдения за пациентами проводились до 12 февраля 2021 года. Группы различались только обнаружением фрагмента последовательности гена S-белка в исследовании ПЦР TaqPath. За каждым пациентом велось наблюдение не менее 14 дней с момента получения первого положительного результата теста на наличие SARS-CoV-2, а более 85 % пациентов наблюдались в течение 28 дней. Из 109 812 участников 367 умерли в течение 28 дней наблюдения (0,3 %). У умерших пациентов средний возраст был выше, чем у остальных (66,9 против 46,3 лет), к тому же мужчины составляли более высокий процент умерших. Среди 54 906 пациентов с отрицательными результатами для гена, кодирующего S-белок, было 227 смертей, а в группе из 54 906 лиц с положительными результатами для гена, кодирующего S-белок — 141 летальный случай (соотношение рисков 1,64, 95 % ДИ от 1,32 до 2,04; p <0,001). Уровень риска смерти участников в анализируемых группах различался спустя 14 дней. Соотношение рисков в первый период наблюдения существенно не увеличилось, в то время как с 15 по 28 дней оно составило 2,40 (1,66 до 3,47). Проведенный анализ показал статистически значимое повышение риска смерти, связанного с заражением вариантом VOC-202012/1.

Обсуждение

Инфицирование новым вариантом SARS-CoV-2 VOC-202012/1 (определенное в исследовании как отрицательный результат для гена, кодирующего S-белок) было связано с повышенным риском смерти. Риск смерти у этой группы пациентов был в 1,64 раза выше, чем у инфицированных другими вариантами вируса, циркулировавшими в то время в Великобритании. Абсолютный риск смерти в этой группе пациентов оставался относительно низким и составлял от 2,5 до 4,1 смертей на 1000 случаев заболевания. Распространение нового варианта SARS-CoV-2 затруднило контроль над пандемией COVID-19. Другие анализы показывают, что новый вариант характеризуется также более высокой инфекционностью, а это означает, что следует ожидать большего общего числа случаев заболеваний и смертей по поводу COVID-19.

Партнеры

Используя веб-сайты и мобильные приложения, администратором которых является Практическая Медицина, Вы соглашаетесь использовать файлы cookie, в соответствии с Вашими текущими настройками браузера, а также в соответствии с Политикой Медицины Практической о файлах cookie.