Магнітний резонанс (MR) – дослідження вибору при захворюваннях гіпоталамо-гіпофізарної системи з огляду на найвищу діагностичну цінність. Він дає можливість діагностувати мікроаденоми гіпофіза (рис. IV.A.2-3A), а також детально оцінити топографію пухлин гіпофіза щодо сусідніх структур (рис. IV.A.2-3B): ніжки, перехресту зорових нервів, III шлуночка, кавернозних синусів, внутрішніх сонних артерій, клиновидної пазухи, як і нервової тканини (рис. IV.A.1-1). Детально візуалізує синдром „порожнього сідла” (рис.IV.A.2-4), як і пухлини гіпоталамо-гіпофізарної ділянки, які не походять з гіпофіза (рис. IV.A.2-5 i рис.V.A.2-6). Зображення MR корелює з інтраопераційним і є необхідним для нейрохірурга. Використання гадолінію дозволяє докладно візуалізувати мікроаденоми діаметром ≥3 мм.